Morphosys zählt global zu den führenden Biotechnologieunternehmen im Segment der vollständig humanen Antikörper. Das Geschäft gliedert sich hierbei in drei Ressorts: Proprietary Development, Partner Discovery und AbD Serotec. Das Kerngeschäft stellt die Entwicklung von therapeutischen Antikörpern dar. Diese werden zur eigenen Medikamentenproduktion verwendet sowie für Partnerunternehmen entwickelt.
Dazu gehören bspw. Novartis, Merck & Co., Pfizer, Boehringer Ingelheim und Roche.

Gegründet wurde das Unternehmen 1992 als Morphosys Gesellschaft für Proteinoptimierung GmbH. Fünf Jahre später ging der Konzern eine erste Partnerschaft mit Pharmazia-Upjohn ein. Durch den Börsengang 1999 öffnete sich Morphosys externen Investoren sowie erlöste rund 25 Millionen Euro. Darüber hinaus begann noch im gleichen Jahr die Zusammenarbeit mit Bayer ? weitere sollten in den Jahren darauf folgen (Schering 2001, Pfizer 2003, Novartis 2004). Zur Verbesserung des Forschungssegments akquirierte Morphosys zusätzlich die Biogenesis Gruppe sowie Seotec Gruppe. Diese trugen 2010 zur Erprobung des ersten firmeneigenen Antikörpers in Patienten bei.

Seit 2004 wird Morphosys im TecDAX der Deutsche Börse AG geführt. Dabei operiert das Unternehmen vom Firmensitz Martinsried (bei München) aus. Um seine Technologie voranzubringen, nutzt der Konzern unter anderem Forschungszentren wie bspw. The Burnham Institute (USA) oder zahlreiche andere in Japan.